Bonsai water geven is het belangrijkste aspect van de verzorging van bonsai. De frequentie waarmee een bonsai water moet krijgen hangt af van verschillende factoren, zoals de soort, de grootte van de boom en de pot, het seizoen, het type substraat en het klimaat. Leer je bonsai te observeren om te bepalen wanneer je water moet geven, en geef water als het substraat droog is. Je kunt je vingers gebruiken om te controleren of je wel of geen water moet geven. 

Je kunt je bonsai het beste 's ochtends vroeg of 's avonds water geven met regenwater en altijd van bovenaf water geven met een gieter met een fijne sproeikop om te voorkomen dat je het substraat verpot. Geef continu water totdat het water door de drainagegaten wegloopt.