Om te voorkomen dat je bonsai krap in zijn pot komt te zitten en uiteindelijk sterft, is regelmatig verpotten noodzakelijk. 

Als je een bonsai verpot, geef je hem de nieuwe voedingsstoffen die hij nodig heeft om te groeien en bloeien. De frequentie van het verpotten hangt af van de grootte van de pot en de ruimte die de bonsai in zijn pot heeft. Snelgroeiende bonsai moeten om de 2-3 jaar worden verpot, terwijl grotere, meer volwassen bonsai om de 3-5 jaar moeten worden verpot.

Het is belangrijk om een bonsai te verpotten wanneer de wortels rond de kluit zitten. Als de wortels nog in de kluit zitten, kun je nog een jaar wachten voordat je opnieuw controleert.